Molekularni skrining test, upotrebom krvnog uzorka dobivenog iz pete, nije dovoljno osjetljiv da otkrije kongenitalnu prenosnu virusnu infekciju u neonatalnim krvnim uzorcima. Uzorci prikupljeni na filter papir se rutinski koriste za testiranje na metaboličke i genetičke bolesti.
Test koji koristi RT PCR (real-time polymerase chain reactions) na suhom krvnom uzorku (DBS) je bio kompariran sa kulturom salive da bi se otkrio CMV. Ključna karakteristika RT PCR procedure je da se amplificirana DNA detektuje kao reakcioni progres u stvarnom vremenu radije nego na kraju procesa. Najčešći metod za detekciju proizvoda u RT PCR koristi nespecifične fluorescentne boje koje se vežu sa bilo kojom dvostrukom DNA ili sekvence specifične DNA probe koje se sastoje od nukleotida koji su vezani sa fluorescentnim reporterom. Jednostruki primer i dvostruki primer RT PCR sistemi su korišteni da bi se detektovala fluorescentna kopija CMV DNA. Rezultati su objavljeni u aprilu 2010 u Journal of the American Medical Association (JAMA).
Uzorci su prikupljeni od novorođenčadi rođenih u sedmom medicinskom centru Amerike kao dijela National Institute on Deafness and Other Communication Disorders’ CMV and Hearing Multicenter Screening (CHIMES) Study (NIDCD; Bethesda, MD, USA). Krvni uzorci uzeti ubodom pete novorođenčadi se rutinski koriste za testiranje na bolesti kao što su hipertireoidizam i anemija srpastih stanica, te se stoga mogu koristiti i u ovoj studiji. S obzirom da je CMV infekcija vodeći uzrok senzoneuralnog gubitka sluha, što može biti neočevidno kod novorođenčadi, time je jedini način da se detektuje virus laboratorijski utemeljen metod tkivne kulture.